一つのライセンスで複数のマシンにあるCloudBerry Backupを使用できますか？

使用できません。
CloudBerry Backupのライセンスは、各マシンごとにご購入いただく必要があります。

Posted in: CloudBerry (MSP360) Backup, CloudBerry Backup　-導入・ライセンスについて