ジャーナルレシーバはテーブル単位で作成する必要がありますか？それともまとめて1つでも問題ないですか？

1つにまとめても問題ありません。DBMotoではテーブル単位でレプリケーション定義を作成し、定義ごとにトランザクションIDを管理することが可能なためです。

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